Con presencia del Ministro Secretario del Consejo Nacional de Ciencia y Tecnología, CONACYT, Ing. Luis Alberto Lima, en la sala del Consejo Universidad Autónoma de Encarnación, se realizó el Acto de Firma de Convenio de Cooperación entre el CONACYT y Universidad Nacional de Itapúa, representada por su Rector Ing. Hildegardo González, la Universidad Autónoma de Encarnación, su Rectora Dra. Nadia Czeraniuk y la Universidad Tecnológica Intercontinental, representada por su Vice Rector Daniel Ferreira.

En la mañana del 22 de junio 2017, en sala de consejos de la Universidad Autónoma de Encarnación, se realizó una importante firma de convenio de cooperación y patrocinio entre la UNAE y Encarnación Rugby Club. Con el objetivo de fomentar el desarrollo del deporte, basado en valores característicos de ambas instituciones.

El 19 de junio de 2017, en el Campus Urbano de la Universidad Autónoma de Encarnación, se realizó la renovación de convenio entre la UNAE y el Mecanismo Nacional de Prevención de la Tortura.

En la mañana del 29 de mayo de 2017, se realizó un importante nio de Cooperación entre la Universidad Autónoma de Encarnación, representada por la rectora Dra. Nadia Czeraniuk y la Asociación Crecer Futuro Paraguay representada por la presidenta Lic. Marta Maciel Goiri.

Desde el 22 de mayo de 2017, la Universidad Autónoma de Encarnación se encuentra adherida al Proyecto de Consultorio Empresarial de INCUPAR, generando alianza con VMMIPYMES para el apoyo a emprendedores a través de la asesoría, actividad que involucra a estudiantes, egresados y docentes de Administración .

El 22 de febrero de 2017, se llevó a cabo una importante firma de Convenio de Cooperación Interinstitucional entre el Ministerio de la Mujer representada por la MSc. Ana Baiardi Quesnel y la Universidad Autónoma de Encarnación representada por la Dra. Nadia Czeraniuk rectora de la Universidad.

El lunes 06 de febrero de 2017, la Dra. Nadia Czeraniuk, rectora de la Universidad Autónoma de Encarnación (UNAE) y la Defensora General Interina, Prof. Abg. Selva Morel de Acevedo en representación del Ministerio de la Defensa Pública, firmaron un convenio interinstitucional para la implementación de programas en áreas académicas, tecnológicas, científicas, culturales, investigación y pasantías para la formación de recursos humanos y acción social.

El 25 de agosto de 2016, la Fundación Paraguaya de Cooperación y desarrollo y la Universidad Autónoma de Encarnación firmaron un convenio marco de cooperación institucional, representada La Fundación Paraguaya, por el Gerente General, el Dr Luis Fernando Sanabria y el gerente de programas, el Sr. Roberto Gustavo, y la UNAE por la Dra. Nadia Czeraniuk, rectora de la UNAE.