Desde el 22 de mayo de 2017, la Universidad Autónoma de Encarnación se encuentra adherida al Proyecto de Consultorio Empresarial de INCUPAR, generando alianza con VMMIPYMES para el apoyo a emprendedores a través de la asesoría, actividad que involucra a estudiantes, egresados y docentes de Administración .
La Rectora Dra. Nadia Czeraniuk y el Sr. Victor Bernal, Vice Ministro de Mipymes, en la sede del Ministerio de Industria y Comercio, Asunción, firmaron un acuerdo entre el Viceministerio de Mipymes, la Asociación Paraguaya de Incubadoras de Empresas y Parques Tecnológicos y la UNAE, para el trabajo en cooperación y asistencia mutua en cuestiones académicas, científicas y tecnológicas.